Med hidtil uset adgang til et lukket fællesskab afslører ’Faderhuset’ de indre mekanismer i den karismatiske kristne sekt – en verden af eksorcisme, tungetale og militant kristendom. Filmen udforsker sektens teknikker til at rekruttere og fastholde medlemmer og undersøger det fysiologiske og psykologiske landskab, der giver en guru magt over sine tilhængeres sind og liv. På rollelisten optræder både tidligere medlemmer af sekten (som sig selv), mens de i filmens iscenesatte lag spilles af blandt andre Trine Dyrholm, David Dencik, Emma Sehested Høeg og Özlem Saglanmak.